尽管K均值聚类方法很有用，但是它有一定的局限：

（1）每个数据点只能属于一个群组。然而，数据点可能恰好位于两个群组中间，无法通过k均值聚类方法确定它应该属于哪个群组

（2）群组被假定是正圆形的。查找距离某个群组中心点最近的数据点，这一迭代过程类似于缩小群组的半径，因此最终得到的群组在形状上类似于正圆形。假设群组的实际形状是椭圆形，那么在应用k均值聚类方法之后，位于椭圆两端的数据点可能会被划人邻近的群组，这会造成很大的问题。

（3）群组被假定是离散的。k均值聚类既不允许群组重叠，也不允许它们相互嵌套。